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Codigo completo de investigacin : 55/C096


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Ttulo : Modelos Bioinformáticos de Markov para Vías Metabólicas en Metagenomas


Ttulo en ingls :


Descripcin : En el proyecto original de este trabajo se expresaba la intención de establecer, a partir de las cadenas de ADN de microorganismos, un Modelo de Markov y un juego de parámetros perfil que tuviera en cuenta la diversidad de la información genética y permitiera reconocer otros microorganismos del metagenoma que estuvieran presentes en las reacciones de la vía. Tal idea conducía naturalmente a probar que el modelo de Markov construido ajustara adecuadamente al sistema y permitiera anotar el perfil para una dada vía metabólica. Pero, como se expresó en el informe de avance, para esto se requería dar por válidas algunas hipótesis auxiliares. En particular se necesitaba suponer que la cantidad de especies y también la de individuos que aportan enzimas a una vía metabólica es mucho mayor que la que puede determinarse por medio de la experiencia biológica en laboratorio. Se vio entonces la necesidad de contar con evaluaciones fidedignas de la cantidad de especies presentes en un medio y de la abundancia de las mismas. La naturaleza de este problema abrió una nueva dirección de trabajo a la cual se dedicaron los mayores esfuerzos dada la complejidad y diversidad de métodos y resultados propuestos para medir la riqueza y la diversidad de un medio biológico. Se observó en la bibliografía la presencia de resultados muy diferentes y la ausencia de una integración y crítica metodológica que permitiera decidirse por alguna forma de cálculo. En este sentido se consideró estar en presencia de un tema que requería una cuota mayor de análisis y que a la vez ofrecía la oportunidad de algún nuevo aporte.


Edita/publica : Universidad Nacional de La Matanza


Fecha evaluacin final : 2010-12-31

 
 
 
 
 

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