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Campo DC Valor Lengua/Idioma
dc.rights.licenseLicencia Creative Commons Atribución-NoComercial-CompartirIgual 2.5 Argentina (CC BY-NC-SA 2.5 AR)spa
dc.contributorSanta María, Cristóbal Raúlspa
dc.contributorLópez, Luisspa
dc.creatorSanta María, Cristóbal Raúlspa
dc.creatorLópez, Luisspa
dc.creatorÁvila, Lauraspa
dc.creatorCacho Mendoza, Arielspa
dc.creatorMartínez, Pablo Witoldspa
dc.creatorOtaegui, Juan Carlosspa
dc.creatorSoria, Marcelo Abelspa
dc.creatorSanta María, Victoriaspa
dc.date2020spa
dc.date.accessioned2024-06-27T11:45:08Z-
dc.date.available2024-06-27T11:45:08Z-
dc.identifierhttps://ror.org/01bmj8t37spa
dc.identifier.citationSanta María, C. R., López, L., Ávila, L., Cacho Mendoza, A., Martínez, P. W., Otaegui, J. C., Soria, M. A. y Santa María, V. (2020). Explotación de datos del microbioma de pacientes con cáncer colorectal (Informe C-220). Universidad Nacional de La Matanza. http://repositoriocyt.unlam.edu.ar/handle/123456789/2003spa
dc.identifier.urihttp://repositoriocyt.unlam.edu.ar/handle/123456789/2003spa
dc.descriptionLos métodos de secuenciación de ADN permiten estudiar comunidades enteras de microorganismos tal como la que constituye el microbioma intestinal humano. Hay un creciente interés médico en este análisis pues las modificaciones que ocurren en la microbiota pueden ser responsables de la disbiosis asociada con enfermedades como el cáncer colorectal sobre el cual se focaliza este trabajo. El proceso bioinformático de las muestras desde que salen las lecturas del secuenciador hasta que pueden ser explotadas como datos, requiere sistematizar y automatizar las tareas procesos ligados a través de programas confeccionados al efecto. También es necesario validar el uso de algoritmos de aprendizaje utilizados en la propia explotación de los datos, para hallar asociaciones y patrones que vinculan la clasificación taxonómica y las vías metabólicas presentes con la condición clínica de los pacientes analizados. El presente trabajo encara ambas tareas. Sobre muestras de microbiomas colónicos, obtenidas del repositorio internacional NCBI (National Center of Biotechnology Information), primero describe y realiza la secuencia de procesos hasta que se obtiene la identificación taxonómica a nivel del taxón Phylum y las anotacionesfuncionales KO. A continuación, elije y evalúa algoritmos de clustering jerárquico, realiza un análisis de componentes principales y estudia la aplicación de árboles de decisión y ensambles sobre esos conjuntos de datos. Se logra entonces poner a punto el proceso de secuencias de ADN obtenidas al utilizar secuenciadores de nueva generación sobre todo el metagenoma. De esta forma se ha podido encarar una segunda etapa de análisis, actualmente en desarrollo, con muestras extraídas de pacientes autóctonos. Estos estudios, procuran avanzar y establecer en nuestro medio, la caracterización clínica del cáncer colorectal por esta vía tecnológica.spa
dc.descriptionFil: Santa María, Cristóbal Raúl. Universidad Nacional de La Matanza; Argentina.spa
dc.descriptionFil: López, Luis. Universidad Nacional de La Matanza; Argentina.spa
dc.descriptionFil: Ávila, Laura. Universidad Nacional de La Matanza; Argentina.spa
dc.descriptionFil: Cacho Mendoza, Ariel. Universidad Nacional de La Matanza; Argentina.spa
dc.descriptionFil: Martínez, Pablo Witold. Universidad Nacional de La Matanza; Argentina.spa
dc.descriptionFil: Otaegui, Juan Carlos. Universidad Nacional de La Matanza; Argentina.spa
dc.descriptionFil: Soria, Marcelo Abel. Universidad Nacional de La Matanza; Argentina.spa
dc.descriptionFil: Santa María, Victoria. Universidad Nacional de La Matanza; Argentina.spa
dc.formatapplication/pdfspa
dc.format.extent41 p.spa
dc.languagespaspa
dc.publisherUniversidad Nacional de La Matanza. Departamento de Ingeniería e Investigaciones Tecnológicasspa
dc.relationinfo:eu-repo/grantAgreement/SPU/PROINCE/C-220/AR.Buenos Aires.San Justo/Explotación de datos del microbioma de pacientes con cáncer colorectalspa
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessspa
dc.rightshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/spa
dc.subjectNEOPLASIAS DEL COLONspa
dc.subjectHERRAMIENTAS Y METODOLOGÍAS BASADAS EN LAS TICspa
dc.subjectBIOINFORMÁTICAspa
dc.subjectMINERIA DE DATOSspa
dc.titleExplotación de datos del microbioma de pacientes con cáncer colorectalspa
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/reportspa
dc.typeinfo:ar-repo/semantics/informe técnicospa
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionspa
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